Clostridioides difficile est un bacille à Gram positif anaérobie sporulé responsable d’un large spectre d’infections digestives dont les complications peuvent être parfois mortelles. Les récidives sont fréquentes (20 à 25 % des patients). En cause, la résistance de plusieurs lignées bactériennes, mais surtout le fait que les antibiotiques recommandés ne luttent pas contre la germination des spores de C. difficile, capables de survivre sous forme dormante plusieurs années avant d’essaimer.Une nouvelle molécule de la famille des oxadiazoles, baptisée sobrement « oxadiazole 1 », pourrait améliorer drastiquement la lutte contre C. difficile, en ciblant la germination des spores et les cellules végétatives de la bactérie. Repéré lors d’un criblage visant à sélectionner des oxadiazoles contrant l’action d’une protéine se liant à la pénicilline chez le staphylocoque doré, l’oxadiazole 1 est peu absorbé par l’organisme et reste dans le tube digestif sans perturber son fonctionnement, où il est très efficace contre les cellules végétatives de C. difficile : sa concentration minimale inhibitrice est faible (4 μg/mL).Les avantages de l’oxadiazole 1 ne s’arrêtent pas là, selon la publication de PNAS consacrée à cet antibiotique. Lors d’expériences en cultures cellulaires, ce nouvel antibiotique est associé à une émergence atténuée d’antibiorésistances par rapport à la vancomycine. Enfin, il est le seul des antibiotiques testés à limiter la germination des spores de C. difficile, même à sa concentration minimale inhibitrice – sans pour autant agir contre les spores dormantes. Son mode d’action anti-germination ? L’oxadiazole 1 se lie à SleC, une protéine qui dégrade l’enveloppe de peptidoglycane des spores de C. difficile – dégradation nécessaire à la germination.Testé in vivo sur un modèle de souris souffrant d’infections récurrentes à C. difficile, l’oxadiazole 1 a confirmé son efficacité. Sur trois groupes de dix souris chacun – oxadiazole 1 (20 mg/kg) versus vancomycine (50 mg/kg) versus excipients administrés oralement –, le groupe oxadiazole 1 montre un taux de survie de 70 % vingt-cinq jours après l’infection, significativement meilleur que le taux de 60 % avec la vancomycine (versus 40 % dans le groupe contrôle). Enfin, seules les fèces des souris traitées à l’oxadiazole 1 n’ont plus de spores au 21jour, signe d’efficacité contre les récidives. Les chercheurs en concluent que l’oxadiazole 1 et les oxadiazoles en général sont des antibiotiques prometteurs dans la lutte contre les infections récurrentes à C. difficile.

Références
PNAS 2023;120(20):e2304110120. Janardhanan J, Kim C, Qian Y, et al. A dual-action antibiotic that kills Clostridioides difficile vegetative cells and inhibits spore germination. PMID : 37155891