Les antibiotiques recommandés dans le traitement des infections causées par la bactérie Clostridioides difficile n’empêchent pas un tiers des patients de rechuter. En cause, la résistance de plusieurs lignées bactériennes, mais surtout le fait que ces molécules ne luttent pas contre la germination des spores de C. difficile, capables de survivre sous forme dormante plusieurs années avant d’essaimer.
Un nouvel antibiotique de la famille des oxadiazoles, baptisé sobrement « oxadiazole 1 », pourrait améliorer drastiquement la lutte contre C. difficile, en ciblant la germination des spores et les cellules végétatives de la bactérie. Repéré lors d’un criblage visant à sélectionner des oxadiazoles contrant l’action d’une protéine se liant à la pénicilline chez le staphylocoque doré, l’oxadiazole 1 est peu absorbé par l’organisme et reste dans le tube digestif sans perturber son fonctionnement, où il est très efficace contre les cellules végétatives de C. difficile : sa concentration minimale inhibitrice est faible, de 4 µg/mL.
Les avantages de l’oxadiazole 1 ne s’arrêtent pas là, selon la publication de PNAS consacrée à cet antibiotique et parue en avril 2023. Lors d’expériences en cultures cellulaires, ce nouvel antibiotique est associé à une émergence atténuée d’antibiorésistances par rapport à la vancomycine. Enfin, il est le seul des antibiotiques testés à limiter la germination des spores de C. difficile, même à sa concentration minimale inhibitrice – sans pour autant agir contre les spores dormantes. Son mode d’action anti-germination ? L’oxadiazole 1 se lie à SleC, une protéine qui dégrade l’enveloppe de peptidoglycane des spores de C. difficile – une dégradation nécessaire à la germination.
Testé in vivo sur un modèle de souris souffrant d’infections récurrentes à C. difficile, l’oxadiazole 1 a confirmé son efficacité. Sur trois groupes de 10 souris chacun – oxadiazole 1 (20 mg/kg) vs vancomycine (50 mg/kg) vs excipients administrés oralement –, le groupe oxadiazole 1 montre un taux de survie 25 jours après l’infection de 70 %, significativement meilleur que le taux de 60 % avec la vancomycine (versus 40 % de survie dans le groupe contrôle). Enfin, seules les fèces des souris traitées à l’oxadiazole 1 n’ont plus de spores au jour 21, signe d’efficacité contre les récidives. Les chercheurs en concluent que l’oxadiazole 1 et les oxadiazoles en général sont des antibiotiques prometteurs dans la lutte contre les infections récurrentes à C. difficile.